اچ آی وی ویروسی بسیار تغییرپذیر است و در شرایط فشار انتخابی درمان ضد رترو ویروسی، جهش هایی در ژنوم آن روي می دهد تا آسیب پذیري آن را نسبت به داروهاي خاص کمتر کند. برخی از جهش ها باعث ایجاد مقاومت در دیگر داروهاي همان گروه می شوند. در شرایطی که احتمال مقاومت به اچ آی وی می رود، درمانگر باید آزمایش تعیین ژنوتایپ یا فنوتایپ HIV را انجام دهد.