مراکز مشاوره بیماری های رفتاری مراکزی هستند که قابلیت ارائه خدمات آموزشی، مشاوره، درمان و پیشگیری و کاهش آسیب را به افراد در معرض بیشترین خطر ابتلا به اچ ای وی و مبتلایان به ایدز و بیماری های آمیزشی فراهم می­کنند. فراهم نمودن امکان دسترسی عموم مردم به مراکزی مطمئن جهت کسب اطلاعات در مورد راه های انتقال و پیشگیری ایدز؛ فراهم نمودن امکان دسترسی گروه های در معرض بیشترین خطر برای ابتلا به اچ ای وی / ایدز و بیماری های آمیزشی و خانواده آنان به خدمات آموزشی، مشاوره، تشخیص اچ ای وی، خدمات کاهش آسیب، مراقبت و درمان بیماری های آمیزشی و افزایش امکان دسترسی افراد در مواجهه شغلی به خدمات تشخیصی و پیشگیری از ابتلا به اچ ای وی، از مهمترین اهداف مراکز مشاوره بیماری های رفتاری است. ارتقای سطح آگاهی و توانمند سازی پرسنل شاغل در مراکز مشاوره بیماری های رفتاری باعث ارتقای کیفیت ارائه خدمات در این مراکز می­شود.