کسری خدمت مشمولان دارای مدرک کارشناسی ارشد و بالاتر به این صورت می باشد که پروژه کسری خدمت تا اوایل سال جاری به صورت متمرکز در ستاد کل و بنیاد علمی نخبگان انجام می‌شد و مراجعه افراد برای این منظور مشکلاتی را ایجاد کرده بود. در سال جاری برای استفاده بهتر از خدمت این افراد پروژه کسری خدمت سربازی این دسته از مشمولان از حالت متمرکز خارج شد، در حال حاضر مسئولیت کار به ارتش، سپاه، ناجا و وزارت دفاع محول شد و ستاد کل نیز امور اجرایی پروژه‌هایی در خصوص روش‌های عالی دفاع ملی را قبول و اجرا می‌کند