شهریه مدارس شاهد بابت فعالیت ‌های فوق برنامه و کلاس ‌های تقویتی و جبرانی مدارس شاهد دریافت می شود . شهریه مدارس شاهد دوره ابتدایی بین 380 تا 640 هزار تومان ، شهریه مدارس شاهد دوره اول متوسطه بین 440 تا 730 هزار تومان و شهریه مدارس شاهد دوره دوم متوسطه بین 530 تا 950 هزار تومان تعیین شده که به حسب شرایط بومی و منطقه‌ای استانها بین این دو رقم خواهد بود . لازم به ذکر است تحصیل برای فرزندان شهداء ، آزادگان و جانبازان 50% و بالاتر در مدارس شاهد به صورت رایگان است .