در سال های گذشته دانشگاه آزاد برای پذیرش دانشجو در مقطع دکتری، آزمون جداگانه برگزار می کرد که علاقمندان به تحصیل در دانشگاه آزاد باید در این آزمون شرکت می کردند و پس از کسب رتبه مجاز، برای انتخاب رشته این دانشگاه اقدام می نمودند. ولی از سال 96 تاکنون تغییرات گسترده در روند برگزاری آزمون دکتری ایجاد شده است