در تحلیل حکم دادگاه مهدی هاشمی مهدی هاشمی نکات فراوانی وجود دارد،از شهریور ماه سال ۸۸ به‌‌دنبال حوادث مرتبط با جریان فتنه با این ادعا که باید به واحدهای دانشگاه آزاد در لندن سرکشی کند، از کشور خارج شد. خانواده وی همان زمان می‌گفتند که این سفر مأموریت کاری است و ارتباطی با دادگاه یا حوادث انتخابات ندارد در حالی که عبدالله جاسبی رئیس وقت دانشگاه آزاد اسلامی اعلام کرد: مهدی هاشمی از رئیس هیئت امنا حکم مأموریت گرفت و من حکمی ندادم.در پی تشدید فشار افکار عمومی برای شفاف‌سازی نقش مهدی هاشمی در مسائل مختلف امنیتی و اقتصادی، عباس جعفری دولت‌آبادی دادستان تهران در فروردین ماه ۱۳۸۹ مهدی هاشمی را رسماً به دادسرا احضار کرد.