فایل سیستم یا سیستم پرونده در حقیقت روشی اختصاصی برای سازمان دهی ذخیره شدن پرونده های رایانه شما است. در حقیقت مدیریت حجم حافظه ، اسامی و فهرست فایل ها در اختیار فایل سیستم است.

هر سیستم عاملی فایل مخصوص به خودش را دارد مثلا ویندوز امروزه از NTFS استفاده می کند یا اپل از سیستمی به نام HFS در سیستم عامل مک ا اس استفاده میکند. اما بی تردید FAT مشهورترین سیستم مدیریت فایل است. سیستمی که در ۱۹۸۰ برای فلاپی دیسک ها طراحی شد تا روی همه کامپیوترها از جمله لینوکس تا مک ویندوز قابل اجرا باشد.